PAINEL NGS DE BAIXA ESTATURA COM CNV [NGS-BE]

Doenças Hereditárias

GENES INCLUÍDOS

(65 genes) ACAN ADAMTS10 ANKRD11 ATR BRAF CBL CCDC8 CDC6 CDT1 CENPJ CEP152 CEP63 CHD7 COL10A1 COL2A1 COL9A1 COL9A2 COMP CREBBP CUL7 FBN1 FGF8 FGFR1 FGFR3 GH1 GHR GHRHR GLI2 GLI3 GNAS HESX1 HRAS IGF1 IGF1R IGF2 IGFALS IHH KRAS LHX3 LHX4 MAP2K1 NPR2 NRAS OBSL1 ORC1 ORC4 ORC6 OTX2 PAPSS2 PCNT PITX2 POU1F1 PRKAR1A PROP1 PTH1R PTPN11 RAF1 RBBP8 SHOC2 SOS1 SOX3 SOX9 SRCAP STAT5B XRCC4

DOCUMENTOS

Pedido médico

Termo de consentimento (Termo de consentimento)

INSTRUÇÕES DE COLETA E TRANSPORTE

Preparo do paciente: Não há (não é necessário jejum)

Material: 4,0mL de sangue total em EDTA (tubo tampa roxa).

Conservação: até 4 dias refrigerado entre 2oC e 8oC

Critérios para amostras recebidas com restrição: volume inferior ao recomendado, prazo de coleta superior ao recomendado, temperatura superior à recomendada.

Critérios para rejeição de amostras: Amostra coagulada, hemolisada ou congelada, anticoagulante inadequado.

METODOLOGIA

Sequenciamento de Segunda Geração (NGS) por Captura e CNV

LIMITAÇÕES DO EXAME

– ACAN: Gene com cobertura média abaixo do padrão (94.71%).

– MAP2K1: Gene com cobertura média abaixo do padrão (95.67%).

– Pseudogenes:

As seguintes regiões apresentam pseudogenes, o que limita a qualidade da chamada de variantes nessas regiões e, portanto, resultados não confiáveis não serão relatados.

ANKRD11: Pseudogene no exon 13

BRAF: Pseudogene no exon 18

GH1: Pseudogene nos exons 1-5

KRAS: Pseudogene no exon 5

STAT5B: Pseudogene nos exons 6-9

– Variantes maiores que 20bp e menores do que um éxon podem ser detectadas com sensibilidade reduzida.

– Análise de número de cópias (CNV) para variantes de um ou mais exons possui uma sensibilidade de >99%.

– Variantes podem não ser relatadas caso estejam presentes em regiões gênicas não sequenciadas adequadamente, regiões ricas em repetições, regiões intrônicas profundas e áreas com pseudogenes.

DOENÇAS RELACIONADAS

Baixa estatura relacionada a causas genéticas.

PALAVRAS-CHAVE

Baixa estatura, crescimento, painel NGS baixa estatura, Acondroplasia.

PRAZO

30 dias úteis

COMENTÁRIOS

-O Painel de Baixa Estatura sequencia os principais genes que regulam o crescimento humano e são associados ao comprometimento da altura.

 

Atualizado em 30/04/2024