EXOMA [NGS-EX]

Doenças Hereditárias

DOCUMENTOS

Pedido médico com descrição detalhada do quadro clínico.

Termo Exoma

INSTRUÇÕES DE COLETA E TRANSPORTE

Preparo do paciente: Não há (não é necessário jejum)

Material: 4,0 mL de sangue total em EDTA (tubo tampa roxa) ou Swab bucal (coleta em kit saliva)

Conservação: 7 dias em temperatura ambiente

Critérios para amostras recebidas com restrição: volume inferior ao recomendado, prazo de coleta superior ao recomendado, temperatura superior à recomendada.

Critérios para rejeição de amostras: Amostra coagulada, hemolisada ou congelada, anticoagulante inadequado.

METODOLOGIA

Extração e validação das amostras germinativas de sangue total ou mucosa bucal. Captura dos éxons do genoma humano utilizando kit customizado. Sequenciamento de nova geração com tecnologia Illumina (Nova Seq XPlus). Alinhamento e identificação de variantes utilizando protocolos de bioinformática, tendo como referência a versão GRCh38 do genoma humano.

LIMITAÇÕES DO EXAME

– Esta metodologia foi validada para identificar variantes de linhagem germinativa, desta forma, linhagens celulares indicativas de mosaico podem não ser identificadas neste exame.

– Variantes  genéticas  localizadas  em  regiões  intrônicas, em  regiões  reguladoras,  em  regiões  repetitivas,  de  homopolímero,  de  alta  homologia  e  regiões  de pseudogene podem não ser detectadas devido a limitações da técnica de NGS.

– O sequenciamento realizado neste exame não detecta variantes estruturais.

– A análise de variações do número de cópias (CNVs) por NGS tem sensibilidade e especificidade reduzidas quando considerados eventos envolvendo apenas um a dois éxons, bem como para variantes e CNVs em genes com pseudogenes e/ou regiões com alto grau de homologia. Ainda, esta análise não identifica anomalias cromossômicas envolvendo cromossomos inteiros (aneuploidias e poliploidias).

PALAVRAS-CHAVE

Exoma, Sequenciamento completo do Exoma, Exoma com CNV e DNA mitocondrial

PRAZO

30 dias úteis

COMENTÁRIOS

Observações:

– As variantes detectadas são classificadas em cinco categorias: patogênicas, provavelmente patogênicas, variantes de significado incerto (VUS), provavelmente benignas e benignas, de acordo com os critérios do College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) definidos em 2015 (PMID: 25741868).

– Serão reportadas as variantes patogênicas, provavelmente patogênicas e variantes de significado incerto (VUS) que possuem correlação com a clínica do paciente.

– Esse laudo é emitido de acordo com o conhecimento científico atual. A interpretação dos resultados e classificação das variantes podem mudar com o avanço do conhecimento médico ou melhoria das ferramentas de análise de dados.

Referências:

– ClinVar – https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/

– HGMD – The Human Gene Mutation Database – http://www.hgmd.cf.ac.uk

-1000Genomes Browser – https://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/tools/1000genomes/

– gnomAD browser beta/GenomeAggregationDatabase – http://gnomad.broadinstitute.org/

– NHLBI Exome Sequencing Project (ESP) – Exome Variant Server http://evs.gs.washington.edu/EVS/

– ExAC Browser (Beta) | Exome Aggregation Consortium – http://exac.broadinstitute.org/

– ABraOM: Brazilian Genomic Variants – http://abraom.ib.usp.br/

– Online Mendelian Inheritance in Man – https://omim.org

– Brazilian Initiative on Precision Medicine – https://bipmed.org/

 

Atualizado em 24/06/2026